События игры разворачиваются в вымышленном мире, населённом несколькими фэнтезийными расами. В центре сюжета — так называемые «Оставшиеся», загадочные древние артефакты, наделённые большой магической силой, а также масштабная война, развязанная таинственной личностью, известной как Завоеватель. Игрок управляет героем по имени Раш Сайкс, который отправляется в путешествие, чтобы разыскать свою пропавшую сестру, позже к нему присоединяются другие персонажи и помогают протагонисту в его приключениях. Геймплей примечателен уникальной боевой системой, с помощью которой игрок способен управлять несколькими группами героев, а не отдельными воинами, как это бывает в большинстве ролевых игр.

The Last Remnant отрежессировал геймдизайнер Хироси Такаи, и это первая игра компании, использующая движок Unreal Engine 3. Президент Square Enix Ёити Вада отметил на этот счёт, что игра «должна стать поворотным моментом в международной стратегии компании». Музыку написал композитор Цуёси Сэкито при некоторой помощи аранжировщика Ясухиро Яманаки, саундтрек бы издан отдельно в виде тройного альбома. Дизайн и диалоги выстроены таким образом, чтобы одинаково хорошо подойти и западным, и японским игрокам, для главных персонажей была отрегулирована синхронность движения губ с репликами актёров озвучивания. В разработке принимали участие продюсеры Акитоси Кавадзу и Юсукэ Наора, известные по работе с различными частями серии Final Fantasy.